水都的守护神的剧场版，事件其实相当简单。
两个世界知名的女盗贼桑娜和莉安，从某个图书馆中找到了传说的宝石“心之水滴”的记载，于是起了盗窃的心思，顺便还想要捕捉拉帝欧斯(蓝水都)和拉帝亚斯(红水都)，于是便抵达了水之都奥多马雷。
她们追击拉帝亚斯和小智一行人，找到了秘密花园的位置，盗窃了心之水滴，并启动了奥多马雷的知名建筑“大圣堂”中的仪器，那个仪器原本是水之都为了迎战敌人而留下的，需要使用心之水滴和拉帝欧斯来启动。
最终仪器失去控制，引发了空前绝后的大海啸，拉帝欧斯和拉帝亚斯使用力量消除了海啸，同时拉帝欧斯也耗尽了能量，在死去之后变成了心之水滴。
在这个城市所发生的一系列事件中，其实主要还是描述小智与拉帝亚斯(红水都)的感情.
有一种说不明道不清的美好感。
从水都城市特有的浪漫感再到妹妹拉帝亚斯和小智之间朦胧的暧昧，朦胧而勇敢的爱意，浪漫而美丽的故事。
人和宝可梦之间的感情，是否已经超越了友情而达到了爱情的地步，以及最后拉帝亚斯对小智的吻别，是影史上最为经典的一幕。
而奥多马雷的大圣堂仪器，毫无疑问是“神秘科学”的产物，就是这个仪器失控之后会引发大海啸自灭，这个设定有些意义不明。
“蕾冠王，心之水滴不是普通的宝珠，如果是普通的宝珠，还可以通过宝珠制作的工艺将其加工出来，但心之水滴需要的材料，是拉帝欧斯或拉帝亚斯的灵魂。”
“即使使用释出之玉作为材料，创造出来的心之水滴也是没有灵魂的，它不具备心之水滴完整的力量。”
“嗯不过，或许还是有转机的。”
既然拉帝欧斯现在是处于昏迷的状态，那也就是说，那颗被污染的心之水滴还没有完全碎掉。
只要及时的将其进行净化，那么一切就都可以恢复正常。
当然，如果拉帝欧斯不死的话，小智和拉帝亚斯的情感恐怕也不会进一步升华.？
毕竟那可是电影的大高潮啊。
“第二个方法就是”
“无限之笛！”
而这个，自己正好会做！
曾经从青色的拉帝欧斯手中得到的无限石板，因此而获得了前往南方孤岛的许可，同时也学会了无限之笛的制造方式。
无