明军在夺取哈密地区之后，立刻把附近的蒙古原残余势力一扫而空，任何敢于反抗的蒙元残余都被斩杀殆尽，尸体被挂在了沙漠胡杨树上，以此来警示任何敢反抗大明朝廷的人。
在清除抵抗之后，大明官府开始对哈密地区进行细致全面的治理。
首先，按照朱瀚制定的大明国策，哈密地区的众多土地被大明官府以租赁或赎买的形式掌握了。
这些土地被分配给那些拥护大明官府的农民和牧民，在获得土地之后，当地的各族农民和牧民自然对大明朝廷发自内心的拥护。
谁要是让大明朝廷退出哈密地区，那就相当于断了这些人的活路和命根子。
除此之外，大明还在各个重要的贸易城市和绿洲都设立了专门的税务管理和巡检司。
这些税关并不是简单的征收税赋，而是在进行认真的核查之后会避免重复征税。
在以前的时候，哈密和其他地区都属于不同的势力范围掌控，几乎每一个绿洲都有一个属于自己的领主。
各个领主之间，并不承认对方征收的税务。
也就是说在哈密地区经商，每到一个地方，就要缴纳一次税赋。
这样一来，就给许多中小商人造成了很大的负担。
而大明却避免了这一情况。
官府专门制定了统一的税票，只要能够在一定区域内任何地方交了商税，那么其他地方凭借缴费凭证，就可以避免重复交税。
这样一来，官府几乎获得了所有中小商人的热烈拥护。
在往常沙漠绿洲之间，经常有强盗土匪出没，专门干杀人越货的勾当。
经过大明官兵和巡检司的联合出动，仅用了不到两个月的时间，就把周围的土匪强盗一扫而空。
其实这些土匪强盗的背后，都有各地领主的影子。
大明官府把那些领主给打压下去，土匪强盗们自然也就没有了生存的土壤。
为了保障这得来不易的和平安定，大明哈密行都司在许多绿洲都设置了屯田兵。
这些大明的屯田兵算是一种生产兵种，他们自己开垦土地，播种粮食，开设简单的兵工厂，还要兼顾当地的治安和日常训练。
在哈密设置屯田兵，也是朱瀚亲自制定下来的战略。
因为哈密地区的各族人民混杂居住，汉人的数量实在是太少了，非常不利于将来的稳定与繁荣。
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