皇耳里，他虽然一心想求仙，但一向自负的他怎会容忍别人的贬低，当场就发飙了：“卢生个大骗子，朕对他那么好，他竟然诽谤我，把他们抓起来狠狠地审，一个都别放过。朕已经查明了，咸阳里还有些儒生也整天搬弄是非，一块端了。”卢生和侯生早逃没影了，怎么办，只好抓些他们的前同事和城里的儒生交差。
这些人为了保命，不管别人有没有议论过秦始皇，都积极举报，多说个名字也好，希望能算上立功。举报来举报去，最后形成了460多人的诽谤罪团伙。秦始皇下令：“全部坑杀，有举报立功的也一样，这帮小人贱民，朕要他们死光光。”这就是坑儒事件的始末。所以坑儒并不像表面意思一样坑的全是儒生，还是方士居多，儒生算是躺枪。
秦始皇这次是真火，想杀鸡儆猴，看以后别人还敢不敢对自己评头论足。别人确实不敢，但秦始皇的长子扶苏觉得他有义务提醒父亲，于是扶苏上奏说：“爹啊，算了吧，天下刚太平不久，这些都是讲文明的读书人，对他们这么狠怕是会引起动乱，望您三思。”秦始皇本来就在气头上，现在更火了，对扶苏说：“你以为是我儿子就可以来说三道四了，谁给你的胆子？给我滚得远远的。”
扶苏为人忠厚，品性贤良，秦始皇心里是认可他的，但他觉得扶苏很烦人，不想他天天在耳边叽叽歪歪的，就下令让扶苏去了北边的上郡，充当蒙恬的监军。
蒙氏一家三代忠良，蒙恬手握重兵，其亲弟弟蒙毅又是秦始皇最看好的文秘，蒙家兄弟深得秦始皇信赖，让扶苏去上郡其实也是让他和蒙恬先搞好关系，为今后接班做准备。可谁曾想，这个决定改变了秦朝的命运。